但专家认为，六神丸的原理实际上是麻痹龟头，长期使用具有表面麻醉作用的药物，也会造成早泄。同时六神丸本身的毒性也不容忽视。

六神丸含有蟾酥，其有效成分为蟾毒素等，一旦滥用将中毒。六神丸还可引起过敏反应，这与用量无关，而且不论内服、外用均会发生。此外，六神丸含有雄黄，为砷的化合物，若与解痉止痛药阿托品等同时服用，会促使雄黄氧化，增加毒性反应。

近年来，滥用六神丸引起的危害已经开始显现。有报道称，使用六神丸超过1年时间的男性，早泄症状已经相当严重，不排除是药物中毒反应。此外，也有网友表示自己的性器官已经开始出现病变。