1、症状 淋病和NGU均有尿道分泌物，程度不等的尿痛和尿道不适、瘙痒感甚至烧灼感。一般较少出现尿急、尿频或血尿。淋病的分泌物大多数为黄色脓性，量多;而NGU则为白色清澈的粘液性，量少。但是，有时也并非如此，甚至相反。因此，根据分泌物的性状来判断属于何种尿道炎，是不可靠的。有的患者会出现一些非特异性症状，如全身不适、下腹坠胀及腰酸等。如见腹股沟淋巴结肿大，提示单纯疱疹病毒感染的可能。
2、体征 尿道口红肿，从尿道内流出脓性、或粘液脓性、或粘液性分泌物。如果分泌物极少，要求患者从阴茎根部向前挤压，看是否有分泌物。
3、合并症 极少数患者如果未经治疗，或治疗不当，可发生某些合并症。如，在淋病患者并发尿道旁腺炎、后尿道炎，以后出现尿道狭窄。淋病及沙眼衣原体感染均可因自身接种而致结膜炎。
在未经治疗的尿道炎中，附睾炎发生率为1%~2%。年轻(<35岁)性活跃的男性附睾炎主要由沙眼衣原体或淋球菌引起，占45%~60%。解脲支原体引起附睾炎仅有个别报告。
淋球菌或沙眼衣原体感染是否导致前列腺炎发生，还有争论。有人发现，在NGU患者中前列腺炎的发生率，并不显著高于无尿道炎者。但是，在性病门诊，以前列腺炎症状就诊的患者还是多见的。目前多认为，由淋球菌或沙眼衣原体或支原体直接引起的前列腺炎并不多，而大多数是因为尿道炎使局部抵抗力下降，因为继发细菌感染而引起前列腺炎，或者因为尿道炎使得原先潜在的前列腺炎加重。
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