冷藏法。将蒜苗充分预冷后装入筐或板条箱内，或直接堆垛在贮藏的货架上，将库温控制在1℃左右。
气调法。①快速降氧法:将蒜苗堆放好并用塑料帐密封后，连续抽氧灌氮3-4次，将帐内的氧含量降到1-3%，在贮藏过程中，氧含量应控制在3%，二氧化碳含量应控制在10%左右。②自然降氧法:蒜苗进帐后，立即将塑料帐密封，帐内的氧气由蒜苗自行吸收，使氧含量逐渐下降到2-4%。以后每天测定、调节，使氧含量保持在所需要的范围内。另外，在蒜苗堆放好并用塑料帐密封后，先吸出少量气体，使帐内氧气与二氧化碳的含量基本相同。随着帐内含氧量的下降，用消石灰吸收二氧化碳，使其含量相应下降。以后氧含量宜控制在1-3%，二氧化碳含量控制在10%，温度应为14-16℃。
