一、烧心开始时心叶叶脉间变褐，以后叶缘细胞逐渐死亡，呈黑褐色。生育前期较少出现，一般主要发生在11~12片叶时。发病原因主要是由缺钙引起的。大量施用化肥后易使土壤酸化而缺钙，施肥过多，特别是氮肥、钾肥过多，会影响根系对钙的正常吸收。另外，低温、高温、干旱等不良环境条件均会降低根系活力，减弱根系对钙的吸收能力，加重缺钙。
防治方法选择中性土壤种植芹菜。对酸性土壤要施入适量石灰，把土壤的酸碱性调到中性。多施有机肥，避免过量施用氮肥、钾肥，尤其不要一次大量施用速效氮肥。避免高温、干旱。温度过高要通风降温。保持土壤经常湿润，小水勤浇，不能忽干忽湿。发生烧心时，要及时向叶面喷施0.5%氯化钙或硝酸钙水溶液，也可喷施绿芬威3号等钙肥。
二、空心芹菜空心是组织老化的一种现象，从叶柄基部开始空心并逐渐向上发展，空心部位出现白色絮状木栓化组织。多发生在土壤瘠薄的地块，特别是中后期遇高温干旱、肥料不足、病虫危害、肥多烧根、缺乏硼素、收获过迟等因素，会使芹菜根系吸收肥水的能力下降，地上部得不到充足的营养，叶片生理功能下降，制造的营养物质不足。在此情况下，叶柄接近髓部的薄壁组织，首先破裂萎缩，形成空心秆。
防治方法选择纯正的高质量的实心优良芹菜品种。选择适宜的地块种植。以富含有机质、保水保肥力强并且排灌条件好的沙壤土为宜，土壤酸碱度以中性或微酸性为好，忌黏土或沙性土壤种植。温度调控。芹菜喜冷凉湿润的环境条件，棚室内栽培芹菜，白天气温以15~20℃为宜，最高不超过25℃。夜间保持10℃左右，不要低于5℃。平时适当通风，降低空气湿度。合理肥水。施足底肥，撒施均匀，每亩施优质腐熟的有机肥5000公斤左右，最好加施发酵好的鸡粪100~200公斤，或磷酸二铵15公斤左右;定植缓苗后施提苗肥，每亩随水施硫酸铵10公斤左右，或施发酵的人粪尿。生长期追肥以速效氮肥为主，配合钾肥，每次每亩施20公斤左右，每隔15天左右追肥一次。为防缺硼空心，可用0.3~0.5%硼砂溶液叶面施肥。小水勤浇，经常保持畦土湿润。此外，还要注意及时防治病虫害和及时收获。
三、叶柄开裂主要表现为茎基都连同叶柄同时裂开。发病原因一是缺硼引起的，二是在低温、干旱条件下，生长受阻所致。此外，突发性高温、多湿，植株吸水过多，组织快速充水，也容易造成叶柄开裂。
防治方法一是施足充分腐熟的有机肥，每亩施入硼砂1公斤，与有机肥充分混匀;二是叶面喷施0.1~0.3%硼砂水溶液。管理中注意均匀浇水。
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