芦荟根腐病发生时，幼苗、成株的根部初现水渍状病变，后呈褐色腐烂。病情扩展迅速并可延及茎部，致植株萎蔫、失绿乃至死亡。
病原
Pythium ultimum Trow称终极腐霉，属卵菌。在CMA上菌落无特殊形状，在PCA上呈放射状，主菌丝宽6.2μm，孢子囊球形或近球形，多间生，个别顶生，大小19~24μm;藏卵器球形，光滑，多顶生个别间生，大小20~23μm;雄器1~3个，多为1个，呈囊状弯曲，典型同丝生，无柄紧靠藏卵器，少数异丝生具柄，大小9.2~12.3×5.5~7.7(μm);卵孢子球形、大小16~19μm，内含贮物球、折光体各1个。菌丝生长适温32℃，最高36~40℃，最低4℃。
发病规律
病菌以菌丝体和卵孢子在土壤中越冬，条件适宜时产生孢子囊和游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。发病后病菌主要通过病健株的接触和菌丝攀缘扩大为害。病菌在病部不断产生孢子囊或游动孢子，借雨水和灌溉水传播，使病害不断扩大，最后又在病部形成卵孢子越冬。该病在温暖多湿的年份和季节易发病。
防治方法
(1)提倡施用保得生物肥或酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥，避免肥料带菌传播病害。
(2)高垄栽培，适时适量浇水，浇水时间安排在上午进行，严防大水漫灌，雨后及时排水，以降低土壤和株间湿度。
(3)及时发现并拔除病株，集中田外深埋或烧毁，病穴应马上撒些生石灰灭菌。
(4)发病初期用20%二氯异氰脲酸钠(菜菌清)可溶性粉剂300~400倍液或70%乙膦·锰锌可湿性粉剂500倍液、72%克露可湿性粉剂600倍液、50%立枯净可湿性粉剂900倍液灌根，每株灌对好的药液200mL。
